Học sâu cho giải trình tự đơn bào: Kính hiển vi để nhìn thấy sự đa dạng của tế bào

Công nghệ giải trình tự đơn bào (sc-seq) cho phép phân tích từng tế bào riêng lẻ, làm lộ ra tính không đồng nhất của tế bào. Bộ gen người chứa khoảng 20.000-25.000 gen mã hóa protein, và sc-seq, đặc biệt là giải trình tự RNA đơn bào (scRNA-seq), cho phép đo lường biểu hiện gen ở cấp độ tế bào đơn lẻ. Học sâu ngày càng được áp dụng cho dữ liệu sc-seq nhờ khả năng xử lý dữ liệu có chiều cao, phi tuyến và không đồng nhất. Bộ mã hóa tự động (autoencoder), đặc biệt là bộ mã hóa tự động khử nhiễu, thường được sử dụng để giảm chiều và phân cụm tế bào, vượt trội hơn các phương pháp truyền thống như PCA. Dự án Bản đồ tế bào người (HCAP) nhằm lập bản đồ tất cả tế bào người, và giải trình tự không gian (SRT) giải quyết việc mất thông tin không gian trong scRNA-seq. Học sâu giúp nắm bắt các mẫu phức tạp, xác định các loại tế bào mới, và tích hợp dữ liệu đa phương thức.