Pembelajaran Mendalam untuk Sekuensing Sel Tunggal: Mikroskop untuk Melihat Keanekaragaman Sel

Teknologi sekuensing sel tunggal (sc-seq) memungkinkan analisis sel individual, mengungkapkan heterogenitas seluler. Genom manusia mengandung sekitar 20.000-25.000 gen pengkode protein, dan sc-seq, terutama sekuensing RNA sel tunggal (scRNA-seq), memungkinkan pengukuran ekspresi gen pada tingkat sel tunggal. Pembelajaran mendalam semakin banyak diterapkan pada data sc-seq karena kemampuannya menangani data berdimensi tinggi, non-linear, dan heterogen. Autoencoder, terutama autoencoder denoising, umum digunakan untuk reduksi dimensionalitas dan pengelompokan sel, mengungguli metode tradisional seperti Analisis Komponen Utama (PCA). Proyek Atlas Sel Manusia (HCAP) bertujuan untuk memetakan semua sel manusia, dan transkriptomik teratasi secara spasial (SRT) mengatasi hilangnya informasi spasial dalam scRNA-seq. Pembelajaran mendalam membantu menangkap pola kompleks, mengidentifikasi tipe sel baru, dan mengintegrasikan data multimodal.