ディープラーニングによるシングルセルシーケンシング：細胞の多様性を見る顕微鏡

シングルセルシークエンシング（sc-seq）技術は、個々の細胞の解析を可能にし、細胞の不均一性を明らかにします。ヒトゲノムには約2万から2万5千のタンパク質コード遺伝子が含まれており、sc-seq、特にシングルセルRNAシークエンシング（scRNA-seq）は、単一細胞レベルでの遺伝子発現の測定を可能にします。ディープラーニングは、高次元で非線形かつ不均一なデータを扱う能力があるため、sc-seqデータへの適用が増えています。オートエンコーダー、特にノイズ除去オートエンコーダーは、次元削減や細胞クラスタリングに一般的に使用され、従来の主成分分析（PCA）などの手法よりも優れた性能を発揮します。ヒト細胞アトラスプロジェクト（HCAP）は、すべてのヒト細胞のマッピングを目指しており、空間的分解能を持つ転写産物解析（SRT）は、scRNA-seqにおける空間情報の損失に対処します。ディープラーニングは、複雑なパターンの捕捉、新規細胞タイプの同定、マルチモーダルデータの統合に役立ちます。